鄂爾多斯生態環境職業學院有生態工程系、生物技術系、機電工程系、經濟管理系、市政工程系、基礎部、中職教育部等院系，以下是具體名單一覽表，供大家參考，如有變動，以學校最新公布的信息為準。

一、院系設置
生態工程系

生物技術系

機電工程系

經濟管理系

市政工程系

基礎部

中職教育部

二、鄂爾多斯生態環境職業學院簡介
鄂爾多斯生態環境職業學院是內蒙古自治區人民政府批準成立、鄂爾多斯市政府投資建設、在鄂爾多斯市農牧學校基礎上組建的一所高等職業院校，學院以培養生態建設、環境保護類應用型人才為重點設置專業，立足當地、面向西部、服務全區，將逐步打造成為以高職教育為主體、中職教育為輔助、成人函授和培訓為補充的多元辦學體系。

鄂爾多斯生態環境職業學院前身為1978年在達拉特旗成立的鄂爾多斯農牧學校，2011年更為為鄂爾多斯生態環境職業學院。