安徽醫科大學臨床醫學院有臨床醫學系、護理系、醫學技術系、藥學與生物醫學工程系、公共衛生與衛生管理系、基礎醫學部、馬克思主義學院、公共課程部等院系，以下是具體名單一覽表，供大家參考，如有變動，以學校最新公布的信息為準。

1、院系設置
臨床醫學系

護理系

醫學技術系

藥學與生物醫學工程系

公共衛生與衛生管理系

基礎醫學部

馬克思主義學院

公共課程部

2、安徽醫科大學臨床醫學院簡介
安徽醫科大學臨床醫學院是2003年由安徽醫科大學創建，是經國家教育部和安徽省人民政府批準設立的獨立學院；是安徽省納入第二批本科錄取的全日制普通高等教育本科院校。
學院秉承安徽醫科大學90余年的文化傳統和辦學理念，堅持“以教學為中心，以學生為主體”的辦學宗旨，堅持“科學定位，特色辦學、質量興校”的發展思路。2017年11月遵照教育部26號令要求，由安徽醫科大學與安徽新華集團投資有限公司合作舉辦，是按新機制和新模式運行的本科高校。2019年，獨立學院轉設納入教育部十三五規劃。