玉溪農業職業技術學院有農林科學技術學院、經濟管理學院、建筑與環境藝術工程學院、信息電氣工程學院、動物科技學院、康養學院、食品藥品學院、馬克思主義學院等學院，以下是具體名單一覽表，供大家參考，如有變動，以學校最新公布的信息為準。

一、學院設置
教學部門
農林科學技術學院    經濟管理學院    建筑與環境藝術工程學院
信息電氣工程學院    動物科技學院    康養學院
食品藥品學院    馬克思主義學院    
二、玉溪農業職業技術學院簡介
玉溪農業職業技術學院（Yuxi Agriculture Vocation-Technical College）是經云南省人民政府批準、國家教育部備案的公辦全日制普通高等學校，是國家教育部現代學徒制試點學校、云南省第110職業技能鑒定所、云南省校園創業示范平臺、瀾滄江—湄公河職業教育聯盟理事單位。
玉溪農業職業技術學院前身是1956年6月成立的云南省玉溪農業學校。1966年3月，更名為玉溪農林學校。1974年1月，恢復為云南省玉溪農業學校。1992年12月，加掛“云南省玉溪煙草栽培學校”牌子，實行“一個機構，兩塊牌子”的管理體制。2002年3月，組建玉溪農業職業技術學院。