黑龍江中醫藥大學有基礎醫學院、藥學院、佳木斯學院、國際教育學院、人文與管理學院、馬克思主義學院、醫學信息工程學院等學院，以下是具體名單一覽表，供大家參考，如有變動，以學校最新公布的信息為準。

一、學院設置
基礎醫學院

藥學院

第一臨床醫學院 附屬第一醫院 護理學院

第二臨床醫學院 附屬第二醫院 針灸推拿學院 康復醫學院

第三臨床醫學院 附屬第三醫院

第四臨床醫學院 附屬第四醫院 黑龍江省康復醫院

佳木斯學院

國際教育學院

人文與管理學院

馬克思主義學院

醫學信息工程學院 現代教育技術與信息中心

體育教研部

公共外語教研部

二、黑龍江中醫藥大學簡介
黑龍江中醫藥大學（Heilongjiang University of Chinese Medicine），坐落于黑龍江省哈爾濱市，是黑龍江省高水平大學和優勢特色學科建設高校，入選國家建設高水平大學公派研究生項目、國家中醫臨床研究基地建設單位、國家“特色重點學科項目”建設高校、卓越醫生（中醫）教育培養計劃、國家級一流本科專業建設單位、中國－匈牙利兩國政府項目“中國－中東歐中醫藥中心”建設單位、中國政府獎學金來華留學生接收院校，全國首批獲得教育部本科教學工作水平評估優秀學校，教育部首批批準招收來華留學生院校之一，教育部高等學校中藥學類專業教學指導委員會主任委員單位，世界中醫藥聯合會中藥化學專業委員會、中藥鑒定專業委員會和生殖醫學專業委員會會長單位，中華中醫藥學會方劑學分會主任委員單位，中國針灸學會副會長單位，全國中醫藥高等教育學會副理事長單位。

學校始于1954年創建的黑龍江省中醫進修學校；1959年，黑龍江中醫學院成立；1996年5月3日更名為黑龍江中醫藥大學；2002年，黑龍江省中醫藥學校并入。