中國科學技術大學有少年班學院、數學科學學院、物理學院、化學與材料科學學院、工程科學學院、信息科學技術學院、計算機科學與技術學院、人工智能與數據科學學院、網絡空間安全學院、微電子學院等學院，以下是具體名單一覽表，供大家參考，如有變動，以學校最新公布的信息為準。

1、少年班學院
2、數學科學學院
數學系

計算與應用數學系

概率統計系

3、物理學院
物理系

近代物理系

光學與光學工程系

天文學系

工程與應用物理系

4、化學與材料科學學院
化學物理系

應用化學系

材料科學與工程系

化學系

高分子科學與工程系

5、工程科學學院
近代力學系

精密機械與精密儀器系

熱科學和能源工程系

安全科學與工程系

6、信息與智能學部
信息科學技術學院：電子工程與信息科學系、自動化系

計算機科學與技術學院

人工智能與數據科學學院

網絡空間安全學院

微電子學院

軟件學院

7、地球和空間科學學院
地球物理與空間科學技術系

地球化學與行星科學系

8、生命科學與醫學部
生命科學學院：分子生物學與細胞生物學系、神經生物學與生物物理學系、系統生物學系、醫藥生物技術系

基礎醫學院

臨床醫學院

附屬第一醫院

生物醫學工程學院

9、管理學院
工商管理系

管理科學系

統計與金融系

10、公共事務學院
11、人文與社會科學學院
科技史與科技考古系

科技傳播系

科技哲學系

心理學系（籌）

12、馬克思主義學院
13、環境科學與工程系（直屬）
14、核科學技術學院
加速器科學與工程物理系

等離子體物理與聚變工程系

核科學與工程系

15、未來技術學院
16、環境科學與光電技術學院（科教融合學院）
17、材料科學與工程學院（科教融合學院）
18、天文與空間科學學院（科教融合學院）
19、納米技術與納米仿生學院（科教融合學院）
20、應用化學與工程學院（科教融合學院）
21、生物醫學工程學院（蘇州）（科教融合學院）
22、能源科學與技術學院（科教融合學院）
23、稀土學院（科教融合學院）