根據教育部公布的高校名單可知：新疆民辦本科大學有新疆農業大學科學技術學院、新疆天山職業技術大學等學校，共計2所。以下是新疆所有民辦本科大學名單一覽表，排名不分先后，希望對大家有所幫助。

序號    學校名稱    省/區    城市    層次    備注
1    新疆農業大學科學技術學院    新疆    烏魯木齊    本科    民辦
2    新疆天山職業技術大學    新疆    烏魯木齊    本科    民辦
新疆農業大學科學技術學院簡介

新疆農業大學科學技術學院（College of Science and Technology Xinjiang Agricultural University）是本科層次獨立學院。已于2020年終止辦學，并入新疆農業大學。學校由2002年7月經自治區教育廳批準成立，2004年經國家教育部重新審批確認，為全國首批確認的124所（其中新疆2所）獨立學院之一，是實施本科層次普通高等教育的獨立學院。

2020年10月25日，新疆維吾爾自治區教育廳發布公告稱，新疆農業大學科學技術學院終止辦學，原學校并入新疆農業大學。